吃榴莲肚子胀与胃火旺盛、胃酸分泌过多、消化不良等因素有关，榴莲本身是热性水果，胃火旺盛的人吃榴莲食会导致病情更加严重，从而对胃功能造成影响，因此会出现肚子发胀感。
榴莲中的糖分含量很高，少量的吃能够补充人体所需要的营养物质，但是大量摄入时由于糖分无法被人体完全代谢和吸收，因此多余的糖分就会对胃腺造成刺激而导致胃酸分泌过多，胃酸分泌过多会对胃的功能造成影响，不仅会出现胃部不适、肠胃发胀的感觉。
部分人本身会有消化不良现象，在吃榴莲时由于榴莲热性大，难以消化，会因此导致肠胃负担加重，从而出现肚子发胀感。