新生儿湿疹的原因很复杂，目前尚未完全研究清楚，主要认为是由于环境因素作用于遗传易感性个体造成免疫调节失常所致。
基本因素就是遗传因素，父母亲有过敏性疾病病史，如患有湿疹、哮喘、过敏性鼻炎，宝宝患湿疹的发生率明显的增高。
还有就是诱发因素，诱发因素当中首先是环境的因素，孕妇经常吸烟或者吸二手烟，以及宝宝出生后穿戴腈纶或者化纤的衣服，经常摩擦都会导致湿疹的。
还有就是饮食，宝宝如果对牛奶蛋白过敏，宝宝吃牛奶时容易出现湿疹，母乳喂养的宝宝如果母亲喝牛奶时宝宝也可能长湿疹。
还有洗护的习惯，如果皮肤过度清洁，可能会导致皮肤透皮水分丢失增加和水保留降低，导致皮肤的干燥，也会诱发湿疹的发生。