人流和药流相比较，药物流产对身体的伤害可能比较小。因为人工流产是采用负压吸引的方式，用吸引器头将宫腔内的妊娠囊以及子宫蜕膜等组织吸出宫腔外，所以人工流产对于子宫内膜的损伤会较大，并且在术后远期会发生宫腔内粘连、宫颈管粘连等，所以人工流产的危害相对于药物流产会较大一些。
药物流产也有其相应的危害，例如药物流产是通过药物的方式使子宫产生收缩，并且使妊娠囊排出，药物流产就容易在流产之后出现阴道流血较长的情况，如果阴道流血较长，则有可能会引起患者的贫血以及感染，必要的时候可能需要进行清宫，所以药物流产也有其危害。