毛发的毛囊炎其实也就是指头皮的毛囊炎，要根治就要养成良好的生活习惯，避免熬夜、上火，以及保证充足的睡眠和休息，保持良好机体免疫状态。饮食要清淡，少吃一些辛辣刺激的食物，避免大量饮酒，都可以使局部毛囊细菌繁殖引起毛囊炎。另外，如果是患有一些基础疾病，特别是像糖尿病、肝病、肾功能不全等等导致机体免疫力下降，就比较容易发生毛囊炎，需要积极控制。
对于毛囊炎本身，轻度可以使用外用抗菌药物，比如夫西地酸乳膏、莫匹罗星软膏、红霉素软膏等进行治疗。严重的可以考虑口服抗菌素，比如头孢类、青霉素类、大环内酯类抗菌素口服治疗，疗程要足量，才能将毛囊的细菌彻底杀灭，使其不容易复发。另外头皮部的清洁卫生也很重要，患者要定期清洁头皮，避免细菌滋生。另外也不要过度的搔抓、烫洗，造成皮肤损伤，否则细菌也容易经损伤部位感染，引起毛囊炎。