做核磁共振对身体是没有辐射的，因为核磁共振是利用体内氢原子核在外加磁场的作用下运动，而进行成像的检查方式，它相对来说非常安全，孕妇和婴儿在特殊情况下也是可以进行此项检查的。
磁共振对身体的影响主要是因为它的检查时间比较长，空间比较密闭，所以患者容易产生恐惧心理，出现头晕以及心率加快等情况，个别比较严重的幽闭恐惧症患者就不能做此项检查。
还有的患者对声音比较敏感，容易产生耳部不适，但是在检查之前都可以通过一些方式来避免，比如患者可以在耳部塞上东西，或有一些核磁共振的专业耳塞可以使用。