细菌性阴道炎的出现主要是由于正常阴道菌群失衡，以乳杆菌占优势的阴道环境被破坏，厌氧菌成为优势的菌群，导致细菌性阴道病的发生。所以细菌性阴道病的治疗，要选择抗厌氧菌的药物，主要有甲硝唑、替硝唑、克林霉素。
因为甲硝唑可以抑制厌氧菌的生长，而不影响乳杆菌的生长，是比较理想的治疗药物。但是具体的用药要在医生的指导下进行使用，医生会根据患者病情全方面评估，选择适合患者的治疗方案。细菌性阴道病的临床特点是带有鱼腥臭味的稀薄阴道分泌物增多，可伴有轻度的外阴瘙痒或烧灼感，性交之后症状会加重。经过系统的治疗之后，这些症状会逐渐地减轻，直到消失。