通常所说的手足口病疫苗是指肠道病毒71型灭活疫苗，适用于六个月到五岁的儿童预防接种，主要用于预防EV-A71病毒感染所导致的手足口病。一般接种两个剂次，间隔一个月以上，同时要与其他疫苗间隔两周以上。肠道病毒71型灭活疫苗属于二类疫苗，二类疫苗的功效和一类疫苗一样。
目前国家将疫苗分为一类疫苗和二类疫苗进行管理，一类疫苗是指政府向公民免费提供的疫苗，公民依照政府的规定进行预防接种的疫苗，主要用于预防严重危害儿童健康的常见传染病。二类疫苗是指公民自费，并且自愿接种的其他疫苗。政府将来会根据该疫苗所能预防疾病，对公众健康的危害程度、疫苗效果、疫苗安全性、国产疫苗生产供应能力，以及政府的财政负担等多方面的因素，会适时将二类疫苗纳入到一类疫苗。