透析治疗是慢性肾功能衰竭最有效的方法，因为慢性肾功能衰竭发生后，由于肾小球硬化、肾小管萎缩、间质纤维化、肾脏明显缩小等，基本丧失了肾脏的功能。毒素代谢产物及水分长期、大量蓄积体内，可引起一系列临床症状，必须进行维持性的透析治疗，清除毒素和水分，挽救患者的生命。
对于存在的肾性贫血、钙磷代谢障碍，以及其他症状等，需要进行药物治疗。慢性肾衰的患者必须进行一周三次的血液透析，每次透析4-5小时，有条件时充分透析30-40次之后可以考虑肾移植，而肾移植是肾脏替代治疗的最佳做法，不仅能够改善代谢功能，同时还能改善内分泌功能。