原发性肾病综合征患者在起病时或者在治疗过程中，容易出现各种并发症，感染是原发性肾病综合征常见的并发症，主要原因是患者蛋白质营养不良、免疫功能紊乱、长期使用激素。患者一旦出现咽痛、咳嗽、发热时，应该引起足够重视，否则感染会导致患者病情加重，甚至会复发。血栓和栓塞症也是原发性肾病综合征常见的并发症，主要原因也是患者低蛋白血症、血液浓缩导致患者出现血栓的形成，主要的部位是肺栓塞、肾静脉血栓以及下肢静脉血栓的形成，还可以出现脑血栓的形成。因此对于原发性肾病综合征患者的高凝状态予以足够的重视，必要时予以抗凝治疗。在治疗的过程中，还可能会出现急性肾衰竭，主要原因是低蛋白血症，容量减少等各种因素造成。部分患者还会出现营养不良、脂质代谢紊乱等，要重视并发症的防治。