肾脏结石长在肾脏的内部，位于肾脏的集合系统。肾脏分为实质和集合系统，实质是指肾细胞、肾小球、肾小管，而肾盂是移行上皮组成的收集尿液的一个囊袋，与输尿管膀胱的内皮具有相同的来源。
肾脏结石长在肾脏里面的肾盂中，并非长在肾细胞、肾小管、肾小球之中。肾脏实质的作用是肾小球、肾小管滤过重吸收尿液以后，然后通过肾乳头，将最终形成的尿液排入肾盂。
肾盂收集尿液，然后送入输尿管排入膀胱。当尿液中形成结石的成分过高，可以在肾乳上形成结晶，结晶体积逐渐增大，从肾乳头上脱落掉入肾盏、肾盂中，形成肾结石。
肾脏结石会造成患者尿路堵塞、感染、肾积水等，会出现疼痛、腰困、腰胀、血尿等特点。