臀部中间骨头疼痛的原因主要见于三方面：一、外伤。特别是外伤以后引起尾骨脱位或者是尾骨骨折的情况，就会导致臀部中间骨头有明显的疼痛、压痛，特别是在坐着时疼痛格外明显。二、肛周部位疾病。比如有肛周脓肿或者是有肛瘘的情况，也会刺激臀部中间骨质出现炎性反应，导致骨头部位有疼痛的症状。三、屁股中间部位的骨质出现了退变、增生或者是骨质疏松的情况，也会引发臀部中间骨头有疼痛症状出现。