肛瘘的症状主要是由于以下多种原因所引起的：
第一、肛周脓肿引起的肛瘘症状，肛周脓肿会在肛门周围形成脓肿或者肿块，这些肿块如果出现破溃的现象，会导致肛周皮肤以及直肠末端受到感染，从而导致炎性病变的出现，进而在肛周皮肤上形成瘘道。
第二、细菌或病毒反复感染引起的，由于肛门部位与外界环境相通，很容易受到外部细菌或病毒的感染，同时长期排便也会造成大量细菌滋生，从而引起肛腺感染的症状，最终在肛门周围形成肛瘘的症状。
第三、外伤以及手术引起的创伤等原因造成的，手术不当引起直肠末端受损，或者饮食不当造成金属划破肛门等，都会使直肠末端黏膜受损，从而给细菌或病毒造成可乘之机，导致伤口反复感染的现象出现。