引起肝病的原因有很多，临床常见的肝病有病毒性肝病、非病毒性肝病及发病率很低的遗传代谢性肝病。
病毒性肝病主要是由于乙肝病毒或者是丙肝病毒引起的慢性乙型肝炎，或者是慢性丙型肝炎，多是由母婴传播途径感染的，非遗传性疾病。非病毒性肝病常见的有酒精性脂肪肝、非酒精性脂肪肝、药物性肝损害及自身免疫性肝病。这些疾病都有明确的致病因素，也不是遗传性肝病。
临床常见的遗传性肝病有铁代谢异常病叫血色病铜代谢异常的疾病，是肝豆状核变性即α1-抗胰蛋白酶缺乏症。遗传代谢性肝病，是指因基因突变引起的肝脏代谢障碍性疾病，只有这三种疾病是遗传性肝病。