艾滋病病人的胃肠道表现，主要还是由于免疫功能低下，引起的继发感染所导致的，对于食道最容易继发感染的是念珠菌病、疱疹病毒，以及巨细胞病毒，这三种病原的感染会引起相应食道病变的症状和表现。对于胃肠道容易继发感染的病原非常多，病毒、原虫、细菌、真菌都会接二连三的引起感染，导致慢性腹泻的表现。
对于食道的念珠菌感染，轻的病人可以没有表现，重的病人常常表现为吞咽疼痛、吞咽不舒服的感觉、有异物感、吞咽困难，或者喝水之后出现哽噎感，胸骨下往往会出现疼痛，病人可有恶心、呕吐，严重的病人可以有黑便、出血的表现。对于食道的疱疹病毒感染，轻微的感染也是没有症状，有症状的多表现为胸骨后的异物感、胸骨后的疼痛，和吞咽的时候吞咽困难或者疼痛，偶尔也有引起食管的出血。对于食道的巨细胞病毒感染，即巨细胞病毒食管炎，表现也是胸疼、吞咽的时候疼痛、吞咽困难、上腹痛，可以出现呕血，甚至出现黑便的一些表现，这是巨细胞病毒引起的食管炎，可以引起食道溃疡的表现，所以可以出血。对于胃肠道继发的各种病原感染，病人主要表现为慢性腹泻，这种慢性腹泻持续的时间比较长，往往会在2-3个月以上，接二连三各种病原的感染，表现为排水样便、稀便、黏液便都是可以的。
所以整个胃肠道的这些表现，其实都是由于各种继发感染、各种病原导致的。
