甲状腺功能的指标主要包括总T3、总T4、游离T3、游离T4以及促甲状腺激素。
甲状腺分泌的激素是T3和T4，垂体前叶分泌的激素是促甲状腺激素TSH。垂体分泌的激素TSH可以作用于甲状腺促进甲状腺分泌T3和T4，同时T3和T4又可以负反馈的抑制垂体分泌TSH。根据这个逻辑，如果T3、T4升高，TSH降低称之为原发性甲亢，如果T3、T4升高TSH也升高称之为中枢性甲亢。如果T3、T4降低，TSH升高称之为原发性甲减，如果T3、T4、TSH均降低，称之为中枢性甲减。