午睡起来头疼通常有如下几个因素：
第一、从骨外科的角度来讲，午睡时如果压迫颈椎，尤其既往有颈椎病病史的患者，导致第2-7节颈椎椎间盘膨出或突出，就会导致睡醒时头疼的症状出现。
第二、脑供血不全或脑血管疾病出现时，例如常见TIA（短暂性脑出血）、脑卒中发作或急性脑梗塞、脑出血等情况时，午睡时就会突然产生剧烈的头疼。
第三、颅内压增高的疾病，例如高血压病反射性引起脑压增加时，午睡起来就会自觉头疼。
第四、大脑缺血和乏氧时，尤其是通气血流比例失衡、脑细胞供氧不足，午睡起来后自觉头痛尤为显著。