维生素B6缺乏会引起一系列临床症状，神经症状有精神淡漠、注意力不集中、萎靡不振、记忆力降低。外周神经系统症状有四肢震颤、麻木，出现疼痛感，维生素B6缺乏也会引起心血管疾病，例如低血压、四肢外周末端的血液循环不足，导致四肢温度下降，引起手脚冰冷。
同样也会引起内分泌失调，例如皮肤水油失衡出现痤疮、痘痘，也会引起营养代谢异常，引起高血压高脂血症、低血糖。最常见的是皮肤症状，例如毛发干枯，皮肤表面干燥缺水出现干皮，严重的会出现频繁脱发，需要及时到医院进行检查，可以服用药物进行调整。