肛门疼痛的原因比较多，主要的多见原因是痔疮或者肛裂导致。如果疼痛比较剧烈，局部的皮温也比较高，有红、肿、热、痛的感觉，这种情况一般考虑是肛周脓肿。
痔疮或肛裂导致的肛门疼痛，可以通过局部的药物进行润滑止痛，再配合以饮食调节，保持大便通畅，一般可以痊愈。如果是肛周脓肿造成的局部疼痛，一定要尽早到医院进行相应的手术治疗，将脓肿引流出去，减少炎症的发生。如果是肛窦炎引起的肛门疼痛，可以用肛内使用的栓剂，减少炎症性的疼痛。