牙源性角化囊肿较严重，与囊肿相比属于颌骨良性肿瘤，有恶变的倾向。牙源性角化囊肿的囊壁存在大量子囊，容易深入周围的牙槽骨及颌骨。在进行手术切除时，如果遗漏，很快能复发并形成新的囊肿。在手术中需扩大切除范围，并用硝酸银烧灼骨面。囊肿的生长速度较快，体积过大时能压迫神经，产生唇舌麻木等症状，并可造成颌骨的吸收。个别过大的角化囊肿会使颌骨骨皮质变得薄弱，容易发生骨折。