对孩子的牙齿进行窝沟封闭处理，能够有效的预防窝沟龋的发生。对于乳牙来说，一般建议3-4岁的孩子做乳磨牙的窝沟封闭，8-9岁的孩子做六龄牙的窝沟封闭，11-12岁左右的孩子可以做第二磨牙的窝沟封闭。做窝沟封闭时候，特别强调孩子的配合，要能够比较好的配合，做好隔湿处理、牙齿表面的清洁。如果牙齿表面不能够比较好的隔湿，窝沟封闭剂比较容易脱落，从而起不到预防蛀牙的效果。孩子比较好的配合时，要认真做好窝沟表面的检查处理。
对于已经有蛀牙的窝沟龋坏要进行补牙处理，不能做窝沟封闭处理，这是做窝沟封闭需要特别注意的地方。如果把浅龋坏进行窝沟封闭处理，就有可能掩盖原来的龋坏，造成龋坏的进一步发展。所以在做窝沟封闭之前，一定要认真仔细的检查是否已经有龋坏发生，同时做好孩子的安抚工作，要做到比较好的隔湿。
另外，做完窝沟封闭之后，建议每半年左右定期的复查是否有龋坏的发生，是否有封闭剂的脱落。如果有封闭剂的脱落，也可以再重新进行窝沟封闭的处理。对牙齿光滑面的处理，可以进行涂氟来预防龋齿的发生，窝沟封闭主要对窝沟龋的发生有比较好的预防作用。