怀孕40多天可以做流产，必须要进行子宫附件的超声检查，明确宫腔内是否存在妊娠囊，是否可以看到卵黄囊、胎芽或者胎心，明确为宫内妊娠，排除宫外孕或者妊娠滋养细胞疾病等相关疾病后才可以流产，可以选择药物流产或者人工流产。药物流产通过口服米非司酮和米索前列醇片，引起子宫收缩将妊娠组织排出体外称为药物流产。也可以选择人工流产，人工流产通过医生操作，将负压吸引头放置到宫腔内，通过负压吸引将子宫内的胚胎组织吸出体外的过程叫人工流产。所以怀孕40天先要明确为宫腔内妊娠后才可以进行流产。