谷丙转氨酶和谷草转氨酶升高是由肝脏损伤所导致，而引起肝损伤主要的原因有病毒性肝炎，包括乙型、丙型、甲型、戊型肝炎，其他的非嗜肝病毒，包括EB病毒、风疹病毒、巨细胞病毒等。还有药物性肝损伤、酒精性肝病、脂肪性肝病、自身免疫性肝病，以及其它不常见的代谢性肝病，比如淀粉样变。
还有一种可能会引起转氨酶升高的原因就是胆道系统疾病，各种原因导致的胆道系统损伤，包括肝内胆道损伤和肝外胆管损伤，都有可能会出现谷丙转氨酶和谷草转氨酶升高，也会出现转肽酶升高。