急性化脓性扁桃体炎最常见的致病菌是乙型溶血性链球菌，这种细菌正常情况下寄生于人体的咽部，当人体的抵抗力减弱；比如出现了着凉、淋雨、过度劳累等情况，乙型溶血性链球菌就会过度增生，从而造成急性化脓性扁桃体炎发作。其他细菌也会引起扁桃体炎发作，比如肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、金黄色葡萄球菌等，当然这些细菌出现的几率比较小。