目前甲肝疫苗有两种，一种是甲肝减毒活疫苗，另一种是甲肝灭活疫苗，由于制备原理的不同，有效性和安全性存在差异，相对于甲肝减毒活疫苗，甲肝灭活疫苗具有更好的稳定性。甲肝灭活疫苗和甲肝减毒疫苗，都是通过侵入人体引起人体的免疫反应，从而使人体产生免疫记忆，达到免疫效果。接种甲型肝炎疫苗八周后，可以产生很高的抗体，获得良好的免疫力，因此甲肝疫苗具有良好的免疫保护作用。
相对于甲肝灭活疫苗，甲肝减毒疫苗产生的免疫速度更快、效果更强烈，甲肝灭活疫苗需要接种两支，两支之间间隔六个月的时间，甲肝减毒疫苗只需要接种一支就可以。甲肝灭活疫苗是世界卫生组织推荐使用的疫苗之一，接种甲型肝炎疫苗之后，抗体的阳性率可以达到98%-100%，具有良好的免疫持久性，免疫力一般可以持续5-10年，5-10年后补种一支，可以保持对甲型肝炎病毒免疫的持久性。甲肝减毒疫苗只需要接种一支，接种方便、价格便宜，甲肝灭活疫苗需要接种两支。