接受脑动脉支架术后的患者容易出现各种并发症，比如可能会出现栓塞以及急性脑梗死，造成患者术后出现血管痉挛，造成供血区域脑组织缺血、缺氧，出现一定程度的颅神经功能障碍。还有些患者容易发生支架远端血管急性或亚急性闭塞，造成患者术后出现颅内出血和蛛网膜下腔出血。
有的患者在接受支架手术后，造成深穿支动脉闭塞以及局部脑组织低血流状态。穿刺过程以及操作介入过程中，还容易对血管内皮造成损伤，导致发生动脉夹层动脉瘤或血管破裂。