新生儿肾积水出生以后，具体多长时间消失，没有完全的界定时间，具有一定个体差异。
多数新生儿如果出现肾积水以后，会在生后的6个月以内逐渐的自我吸收且消失。大部分的新生儿肾积水，是由于集合管系统分离所以导致。如果新生儿肾积水的量较少，少于1厘米，肾功能正常，宝宝状况良好，在这种情况下，多数可完全自我吸收。少部分的新生儿肾积水，积水量比较多，时间较长，如果6个月以后仍未吸收，需及时在到医院就诊，必要时可能要进行手术治疗。患儿长期随访很重要，建议选择一家值得信赖的儿科医院，定期去检查尿常规、肾功能和肾脏B超，观察疾病的进展情况。如能在新生儿期解除轻度肾积水的梗阻，则肾功能及形态可完全恢复正常。
新生儿肾积水85%是生理性的，仅有15%需要手术。发现胎儿的肾积水不要过于担忧，不必急于终止妊娠，应于B超发现后1小时或1周后复查。如果随访中尿常规正常，B超提示肾积水没有进展，则不必太担心。