肉芽肿性乳腺炎如果不经过治疗病情一般很难控制，因为肉芽肿性乳腺炎是一种免疫性炎症，不经过治疗患者的炎症会长期反复出现，病情会时好时坏，有时局部表面愈合，但是乳腺腺体内部的肉芽肿病变并没有达到完全治愈，往往会容易出现复发。
长期以往患者容易形成乳腺瘘或者乳腺窦道，对于患者均能造成比较大的影响，有时影响哺乳及乳腺外形的美观。因此，对于肉芽肿性乳腺炎一定采取治疗措施，包括局部微波理疗、中药外敷，必要时也可以采取肉芽肿性乳腺炎的局部切除或者乳腺区段的切除治疗，治疗效果可能更理想，减少了并发症的发生。