甲状腺过氧化物酶抗体高不是治疗的指征，甲状腺过氧化物酶抗体是甲状腺自身抗体之一，它是免疫系统在保护甲状腺的时候，甲状腺本身就具有的甲状腺过氧化物酶，认为是敌人产生了自身防御，甲状腺过氧化物酶是自身抗体之一，它高往往来诊断甲状腺自身免疫性疾病，桥本氏甲状腺炎。
桥本氏甲状腺炎是自身免疫性甲状腺炎里面最常见的一种，由于自身免疫炎症可以对甲状腺组织产生破坏，最后发生甲状腺功能的异常。有人出现一过性的甲状腺激素水平增高，也有可能合并弥漫性甲状腺肿伴甲亢。
很多自身免疫性检甲状腺炎桥本氏病的患者，最后出现甲减的机会明显增高。桥本氏甲状腺炎的治疗主要是针对甲减和甲状腺肿的压迫症状，甲状腺自身抗体包括甲状腺球蛋白抗体和甲状腺过氧化物酶抗体阳性，并不是治疗的指征。因为目前没有明确的手段，能够对自身免疫异常进行干预。