腹泻奶粉主要是不含乳糖，用于腹泻一周以上不见好转的小孩。普通婴儿奶粉含有大量的乳糖，发生腹泻时消化乳糖的酶活性下降，甚至会停止分泌。如果腹泻的孩子继续使用普通奶粉，不能被消化的乳糖大量堆积在肠道内，容易被细菌分解，产酸、产气，发生腹痛、腹胀，孩子的腹泻会加剧，经久不愈。
水解蛋白奶粉是用于治疗过敏或者预防过敏的奶粉，它分为部分蛋白水解奶粉和深度蛋白水解奶粉，还有氨基酸奶粉。部分水解蛋白奶粉适用于比较轻的牛奶蛋白过敏的婴儿，或者为了预防牛奶蛋白过敏，在生后早期采用的一种奶粉；深度水解奶粉用于比较重些的牛奶蛋白过敏的孩子；氨基酸奶粉适用于最严重的牛奶蛋白过敏的孩子。