腮帮子肿痛的原因，可能是流行性腮腺炎病毒，因为这种病毒可以导致流行性腮腺炎，出现腮腺的肿大。同样，其它的病毒感染也有可能导致腮腺的肿大，包括副流感病毒、流感病毒等。除了病毒之外，细菌感染同样也可以引起腮腺的炎症，这时往往是化脓性的腮腺炎，与病毒导致的腮腺炎不同，在腮腺管的开口处很可能会见到脓液，是用来鉴别的要点。腮帮子肿痛也有可能不是由腮腺肿大引起，是由局部的淋巴结或者软组织的肿胀导致，甚至是因为口腔、牙龈的疾病导致。所以具体腮帮子肿痛也要进行这方面的鉴别，具体鉴别的手段是通过腮腺的彩超，以及通过血淀粉酶的测定。