艾滋病窗口期时具有传染性，虽然艾滋病窗口期时HIV抗体阴性，但此时已经感染了HIV病毒，此时的HIV病毒已经存在于血液、精液、阴道分泌物、脑脊液、胸腹水、羊水、乳汁等体液当中，故此时也是比较危险的人群，因为尚不知道自己已经患有艾滋病，但已经具有传染性。
窗口期通常是在感染HIV病毒之后的2-4周，也有部分患者短则一周，长者则超过三个月。艾滋病窗口期之后进入艾滋病急性期，会出现HIV病毒血症的症状，主要以发热症状为主，也常可见到淋巴结肿大，急性期一般经过1-3周的时间进入潜伏期，潜伏期通常可以达到6-8年的时间，如果经过抗病毒的有效治疗，时间可以延长，之后可以进入到艾滋病期。