尖锐湿疣的用药有口服药、外用药和静脉点滴药，尖锐湿疣属于一种病毒，其治疗以抗病毒为主，可以静脉点滴更昔洛韦注射液。如果合并有炎症，可以静脉点滴消炎药，像头孢曲松、乳酸左氧氟沙星等。此外，可以口服抗病毒药，像盐酸伐昔洛韦颗粒、泛昔洛韦片、阿昔洛韦胶囊等。
患者可以用提高免疫力的药物，像转移因子胶囊、溶菌酶肠溶片、脾氨肽口服液等。还可以有外用药物，像5%的咪喹莫特乳膏、0.5%的鬼臼毒素酊，或者25%的竹叶草脂涂剂，还可以外用干扰素凝胶局部涂抹，以防复发。