临床上对于多发肝囊肿，一般可采取以下处理方法：
一、保守观察治疗，多适用于囊肿体积较小，患者没有明显腹痛、腹胀等症状，抽血化验提示肝功能在正常范围之内，这种情况考虑囊肿属于良性病变可暂时密切观察；
二、超声引导下的介入治疗，适用于囊肿体积在5-10cm左右，可以通过超声引导下肝囊肿穿刺抽吸出囊液，向囊肿内注入硬化剂，可促使囊肿自行萎缩、吸收，超声引导治疗多发肝囊肿创伤较小但容易反复发作，必要时可多次介入治疗；
三、手术治疗，多适用于体积大于10cm以上的多发肝囊肿，可行腹腔镜下肝囊肿开窗引流、网膜填塞，腹腔镜下囊肿手术最大的优点是能够减少囊肿的反复发作。