晨尿和非晨尿中HCG的水平会可能有一定的差别，在晨尿中HCG的浓度会高于非晨尿浓度，原因是晚上喝水少，上厕所的次数也少，尿液相对于白天更加浓缩，所以尿液中HCG的浓度会比白天的HCG浓度高一些。
也有可能晨尿和非晨尿中HCG的浓度是没有什么差别的，主要见于如果人一天到晚喝水很少，吃的食物也不多，就很少上厕所，在这样的情况下，晨尿中HCG浓度和非晨尿中HCG浓度就没有差别。
由于体内激素水平是影响尿中HCG浓度的主要因素，如果停经时间30多天，晨尿和非晨尿中HCG水平都会非常高，两者之间的差别已不重要。