反复查肺结核均阴性的患者一般传染性相对比较低，或者根本就不是肺结核，不具有传染性，但是不排除患者留痰不标准，患者未留深部痰或者是清晨痰而出现假阴性。
如果患者有典型的肺结核症状，如咳嗽、咳痰、低热、盗汗、乏力，同时肺部影像学示上叶尖后段、下叶背段渗出，伴有空洞或干酪性肺炎。这种情况就高度怀疑是活动性肺结核，即使结核菌为阴性，也不能排除为不传染的肺结核，需要隔离治疗，正规的抗结核治疗原则是早期、规律、全程、适量、联合，而且对于部分患者还需要做药敏试验，排除耐药性肺结核，对于防止耐药性肺结核发生的最佳策略是全程督导治疗。