血窦是一种正常的生理结构，所以不存在治疗的可能性。毛细血管分为三类，也就是连续毛细血管，有孔的毛细血管以及血窦，血窦是指管腔较大、管壁较薄、形状不规则的一种毛细血管，其内皮和细胞间有比较大的间隙。血窦主要分布在脾、肝、骨髓以及内分泌腺中，血窦本身是正常的生理结构，所以并不需要治疗。
如果是静脉窦，也就是硬脑膜窦、硬脑膜静脉窦，这个位置发生血栓则需要治疗，有时人们会把这个位置称为血窦，但其并非正规的命名方式。因为静脉窦血栓一旦形成，可能会导致头痛、高颅压，甚至脑疝，危及生命。所以应尽早进行足量、足疗程的抗凝治疗，使大部分静脉窦的血栓复通，从而达到缓解病情，并预防远期并发症的作用。