链霉素可能会引起以下副作用，包括链霉素引起血尿、排尿次数减少或尿量减少、食欲减退、口渴等肾毒性症状，少数可产生血液中尿素氮以及肌酐值增高。
链霉素还可能会影响前庭功能，患者可能会出现步履不稳、眩晕等症状，影响听神经，出现听力减退、耳鸣、耳部饱满感，链霉素可能会引起部分患者出现面部或四肢麻木、针刺感等周围神经炎症状。
链霉素还会偶然会发生视力减退，如视神经炎，还有可能引起嗜睡、软弱无力、呼吸困难等神经肌肉阻滞症状。链霉素也有可能引起皮疹、瘙痒、红肿，少数患者停药后仍可发生听力减退、耳鸣、耳部饱满感等耳毒性症状，应引起注意。