血红蛋白尿和肌红蛋白尿，首先得与血尿进行鉴别，可通过尿常规检查是否存在红细胞来明确诊断。
如果存在红细胞那么为血尿，如果没有红细胞存在，且尿色呈现出浓茶色、葡萄酒色暗黑色，那么考虑为血红蛋白尿和肌红蛋白尿。
血红蛋白尿是发生血管内溶血，血浆大量游离，血红蛋白滤入原尿，超过了肾小管的重吸收郁滞所致。
肌红蛋白尿是因为肌红蛋白受损伤的，从肌肉组织中释放出来，由肾小球滤过而导致，正常的尿隐血试验为阴性。
当出现血红蛋白尿和肌红蛋白尿的时候，尿隐血试验示阳性，R红细胞为阴性，血红蛋白尿和肌红蛋白尿的鉴别点主要是通过病情进行鉴别。
血红蛋白尿见于溶血性贫血、血型不合输血、恶性疟疾、大面积烧伤以及阵发性睡眠性血红蛋白尿等。
肌红蛋白尿见于挤压综合征、缺血性的疾患、先天性肌细胞磷酸化酶缺陷以及正常人的剧烈运动以后，所以病史在鉴别血红蛋白尿和肌红蛋白尿中扮演着重要的角色。