龟头上面有小黑点原因是比较多的，要考虑是色素斑、色素沉着或者色素痣引起。比如有龟头炎存在时，使用含激素类的药物进行治疗，就会遗留色素沉着的副作用。阴茎长期勃起，龟头局部长时间处于充血状态下也会引起龟头发黑，局部就会有黑点的存在。包皮过长的患者，对龟头以及阴茎的血循环也会有所影响，导致局部缺血从而出现龟头黑点的表现。也考虑是长在龟头表面的痣，因为痣是长在人体表面的一种良性肿瘤，人体的任何部位都是可能会生长的，这种情况不需要做特别的处理，而且对男性也不会有太大的影响。可以到医院就诊让医生检查，如果是以上疾病引起需要及时的进行治疗。