咽喉肿瘤的病因和发病机制复杂，遗传因素及环境因素共同参与发病。但普遍认为咽喉肿瘤与吸烟、饮酒关系极为密切。吸烟的总量与发病率呈正相关，也与性激素、病毒感染、癌前病变等有关系。
1、吸烟和饮酒：咽喉肿瘤与吸烟和饮酒关系极为密切，吸烟的总量与咽喉肿瘤的发病率呈正相关。在65岁以上的患者中，吸烟者患咽喉肿瘤的风险是非吸烟者的9倍，当吸烟与饮酒共同存在时则会发生相加或重叠的致癌作用。
2、性激素水平：咽喉肿瘤多发生于中老年男性，可能与男性体内的雄激素水平有关。
3、病毒感染：人乳头状瘤病毒是一种常见的感染，如果以喉乳头状瘤在人体内生长，进一步发展可转变为癌症。
4、癌前病变：咽喉的一系列疾病，经久不愈，长时间可转变为癌。
5、遗传因素：只能说遗传因素是患咽喉肿瘤的一个致病因素，不能说患咽喉肿瘤都是遗传因素所致。
6、环境因素：咽喉肿瘤的发生率与职业因素与环境因素有不同程度的关系，以接触铜、铝、铬、铅等金属的工人发病率为高，与接触时可长短密切相关。