新生儿吃母乳总是被呛到有两种原因：一种就是母亲的因素；另一种是新生儿自身的因素。母亲的因素可能是乳汁分泌特别充足，导致新生儿在吸吮的过程中奶汁流速太快，新生儿由于吞咽不协调，在之过程中容易导致新生儿呛奶，还有新生儿在吃奶的过程中是比较费劲的，如果新生儿发生吃吃停停，在休息的片刻奶汁不断的流出，但此时新生儿没有吞咽，也可以导致新生儿呛咳。
此外，新生儿自身的原因，要看新生儿是否有其他先天畸形，比如是否有先天性心脏病、食管-气管瘘，以及先天性的喉软骨软化等相关的疾病，在吃奶的过程中就容易发生呛咳。总之新生儿呛咳容易导致新生儿发生吸入性肺炎，严重的时候会导致新生儿缺氧，还是要及时到医院去就诊。