通常卵磷脂没有最佳服用时间，对于饭前、饭后服药没有明显差别，如果饭前服用消化道有不适，也可以改为饭后服用。
卵磷脂是处方药，主要是用来脂肪肝、动脉粥样硬化等疾病的辅助治疗，最佳服用时间，对于饭前、饭后来说服药没有明显差别。如果饭前服用有一定消化道刺激、不舒服，也可以改为饭后服用，对药物的吸收、作用没有明确的影响。需要注意此药应在医生的指导进行使用，且每次定时定量的来服用药物，同时应该服用一段时间，以便产生药效。对于使用期间，如果发生任何不适或者严重症状的出现，应该及时到医院就诊或者定期到医院复查复诊，既能保证用药的安全，也能对治疗和疾病的缓解起到一定的帮助，可以由医生进行用药的调整。
卵磷脂在吸收的过程中会产生过多气体，而导致有腹胀情况，所以有胃炎、胃溃疡的病人要少食卵磷脂。另外，妊娠妇女或疑为妊娠妇女，在食用卵磷脂时一定要遵循医嘱。