舌根淋巴组织增生主要是由于慢性咽喉炎，以及胃食道反流所引起的舌根黏膜的滤泡增生。由于胃食道反流，胃酸会刺激咽喉部的黏膜，以及舌根黏膜出现淋巴组织增生。另外，慢性咽喉炎也会引起咽喉部的黏膜出现增生。
如果平时没有咽干、咽痒、咽异物感的症状，可以不予处理。如果出现咽部不适感、咽异物感、咽干、咽痒，同时有咽部的痰液，这时可以行药物治疗和淡盐水漱口。另外，可以用含化片含服，在饮食上要避免辛辣、刺激的食物，多吃营养丰富的清淡食物。