蝙蝠在屋里飞是不会传染病毒的，蝙蝠是病毒的自然宿主，也就是蝙蝠身上有很多种病毒，目前被发现的已经有4100多种，具有超强携带病毒的能力。
但是不会把病毒直接传播给人类，而是先通过传播中间宿主，例如果子狸、穿山甲等哺乳类动物，通过中间宿主才会传播到人类身上，人类大多是因为捕食野生动物感染上病毒的。
也有可能是通过蚊子、虱子等寄生虫进行传播，蝙蝠直接叮咬或者抓伤传播也有报道，但是传染的几率不多。