上完小便后尿道会疼可能有多种原因导致，可能是由于急性尿道炎以及其他尿路感染所导致。
同时可能会伴随着排尿时尿道内灼热感或者尿频、尿急、小腹胀痛等其他症状，可以吃三金片或者左氧氟沙星等抗生素进行治疗。或者由于泌尿系统受到外伤，例如受到直接的外力打击，也会产生排尿后疼痛的症状。
还有可能是由于尿道结石引起，患有尿道结石的患者，排尿时可能会出现尿道疼痛的症状，同时伴随排尿分叉、排尿不通畅等其他症状。
除了上述原因之外，还可能由于肾炎所导致，肾炎也会导致排尿后疼痛以及尿血等症状。建议去正规的医院进行检查，查清尿痛的原因，进行对应的治疗。