磁共振的成像主要是靠人体体内的氢质子，身体的大部分器官核磁共振都是可以做检查的，加上现有的磁共振序列很多，多数疾病可以通过磁共振平扫及弥散加权序列、增强检查等，作出诊断。
比较有优势的检查，如中枢神经系统的疾病及脑胶质瘤的定性诊断、分级诊断等。
在骨骼肌肉系统方面，磁共振以完美的分辨率可以看到很多细微的结构，对诊断也很有帮助。
一般磁共振这种检查，都需要在医生的指导下进行，平时也要注意避免过度检查，对身体产生不良影响。