胃镜是通过导管插入胃内的摄像头，可以直接看到胃内的情况，包括胃黏膜的颜色和形状、炎症、糜烂、溃疡、肿瘤等。
如有异常可取出组织进行病理检查，胃彩超是在腹部用超声探头查看胃的情况，也可用于胆囊、胰腺、食管等疾病诊断，最终的诊断仍需胃镜的证实。
胃彩超优点是通过胃的四个层面来观察胃病，缺点是对胃黏膜、肌层等疾病的判断准确性略有不同，不能进行活检检查。
胃镜优点是可直接观察食管、胃、十二指肠等黏膜有无糜烂、充血等变化，缺点是一种侵入性手术，对于病人有耐受的要求，所以胃镜和胃彩超的区别如上所述。