不同的甲状腺疾病，有可能引起不一样的甲状腺相关的并发症。首先，甲亢如果没有得到及时的诊断和治疗，可能会出现甲亢心脏病、心律失常、心脏增大，甚至心肌收缩力下降，引起心功能衰竭，以及各种的心脏异常。通过积极控制好甲亢，甲亢、心脏病都能够完全康复。其次，如果是甲状腺可能出现甲状腺明显的突眼，可以是轻度突眼，也有可能是严重不断进展的浸润性突眼。
患者和眼科医生共同组成的多科团队，帮助患者控制好甲亢，同时对眼睛进行专科的治疗。另外，如果甲状腺功能亢进没有及时的诊断治疗，同时存在像感染或创伤引起甲亢危象，即使积极抢救，50%的患者都有可能死亡。另外，要积极预防甲亢危象、甲状腺功能减退，如果没有及时诊断治疗，也可以引起严重的并发症，叫做黏液水肿性昏迷，表现是体温明显降低，以及呼吸循环都受影响，病人意识不好，出现昏迷，通过积极治疗虽然有一定疗效，但是仍然死亡率比较高。