若是既往有过不洁的性生活史，则肛门处有一个肉疙瘩多考虑为尖锐湿疣，多由HPV病毒感染引起，表现为肛门周围可见菜花状的疣体，可合并有溃疡或疼痛不适。若在肛门口触及质地软且边界清楚的肉疙瘩，应考虑患有肛乳头瘤，由肛门慢性炎症性改变引起，通常无明显的临床表现。
若出现便后肛门滴血或者大便混有新鲜血时，肛门处有一个肉疙瘩主要考虑为痔疮，可以分为内痔、外痔及混合痔，常合并有肛门坠胀和瘙痒不适感。若肛门处的肉疙瘩形态不规则且质地硬，边界不清楚，应考虑肛管癌，多种疾病可以表现为肛门处有肉疙瘩，应及时就医，明确病变性质，必要时行手术治疗。