膀胱肿瘤进行膀胱灌注，可能会带来副作用或者后遗症，其中包含：1、泌尿道感染，因为每次膀胱灌注的过程都需要给予留置导尿管，而且在早期灌注需要间隔1周灌注1次，所以会出现尿道感染而导致尿频、尿急或者排尿疼痛的症状，而且往往感染持续的时间比较长难以康复。2、化学性膀胱炎，膀胱肿瘤进行灌注都使用化疗药物，化疗药物都对膀胱黏膜有一定刺激性，长期灌注的过程中就会造成膀胱黏膜的损伤而造成小便疼痛、膀胱疼痛或者尿不尽感等症状，停止灌注以后这种情况可逐渐消失或者改善。3、血尿，经过膀胱灌注以后，泌尿道短时间内可以出现黏膜的糜烂、出血，这时排尿过程中可以出现出血或者伴有血凝块的现象。